利奈唑胺的最常见的不良反是腹泻、恶心呕吐等胃肠道症状及头痛、皮疹等。发生率较高的严重不良反应为骨髓抑制，包括白细胞减少、贫血及血小板减少。利奈唑胺致血小板减少目前尚无统一的诊断标准。
Gerson等在2002年使用的血小板减少判定标准为血小板基线值(开始治疗前血小板检测值)大于或等于正常下限(血小板计数≥100×109/L)、用药后血小板计数小于正常下限的75％，或者血小板基线值小于正常下限(血小板计数<100×109/L)、用药后血小板计数小于基线值的75％。
利奈唑胺（斯沃）相关血小板减少的主要危险因素包括基础PLT<200×109/L、肌酐清除率<30ml／min、体重<50 kg、用药疗程>14 d和年龄>65岁。Cattaneo等认为，老年患者组织器官退化，机体代谢速度减慢，易产生药物蓄积。
